A Washington DC, Mika Bering, un agent des services secrets fait des dernières vérifications dans un musée. Le patron du musée, Chet Greenfield lui présente Gordon Letanik, un employé du musée qui nettoie une sculpture en pierre de sang azteque pour la réception qui sera donnée le même soir, mais il s'entaille le doigt, laissant du sang sur la sculpture.
De son côté, Pete Lattimer, un autre agent des services secrets est avec une conquête. Il ne tient pas à lui révéler ce qu'il fait dans la vie.
Le soir de la réception, Myka s'assure de son bon déroulement, accompagnée d'autres agents. Elle voit Pete entrer et demande à ses collègues qui est à l'entrée Emeraude. Normalement, il était censé y être. Le président doit entrer dans la salle, mais aucun des deux agents n'est d'accord : Pete a un mauvais présentiment et ne veut pas qu'ils le fasse entrer, tandis que Myka, voyant que tout se passe bien, veut que le président entre. Mais doutant finalement, elle décide de faire faire un controle du périmètre.
La sculpture aztèque est exposée dans la salle, et Gordon Letanik, le visage en sueur et le regard parsemé de vaisseaux sanguins visiblements rouges, l'observe insistament comme absorbé par elle.
Les agents ayant tout contrôlé, affirment qu'il n'y a rien à signaler, puis l'un d'eux est neutralisé par un homme qui entre ensuite dans un ascenseur.
Pete marche en veillant sur la salle de réception, quand il arrive à la hauteur de la sculpture. Il se rend vite compte que tu sang coule de la pierre et décide de l'emporter hors de la salle. Myka, elle, donne la permission de faire entrer le président. Elle croise Gordon et remarque des taches de sang qui le suivent. Elle retire ses chaussures, et voit l'homme sortir une arme blanche de sa manche. Elle attrape son pistolet et tout en le rattrapant, elle ordonne à son équipe d'évacuer le président. Elle réussit à l'intercepter, mais s'en suit un combat entre l'agent Bering et l'employé du musée. Elle récupère enfin son arme et le neutralise.
Pendant ce temps, Pete, trébuche et fait tomber la sculpture en forme de tête, qui roule au pied de l'homme qui avait un peu plus tôt neutralisé un agent. Il sort quelque chose de son sac, qu'il pose sur la pierre. Pete tente de l'en empêcher, mais en vain. Une puissante lumière s'échappe de la sculpture en fait reliée à Gordon, qui hurle.
Pete, qui s'était protégé les yeux de la lumière, se rend compte que l'homme a disparu, et que les taches de sang venant de la pierre s'effacent.
Du à cet incident, Pete est mis à pied, et Dickinson lui demande même de faire des analyses d'urines pour voir s'il n'a pas pris de substances illicites. Personne n'a vu cet homme mystérieux emporter la sculpture. Myka ayant parfaitement protégé le président, elle reçoit les félicitations.
Pete rentre chez lui et trouve une femme dans son salon. Elle se présente comme étant Mme Frederic, travaillant pour le gouvernement. Elle est en fait venu pour lui annoncer qu'il est dorénavant affecté dans un autre département, sans préciser la nature des services qu'il devra fournir à l'avenir. La seule chose qu'elle lui laisse entendre sur cette future affectation, c'est qu'il y aura de l'insolite et du bizarre. Sur le coup, l'agent Lattimer pense à une blague, mais il comprend très vite que ça n'en est pas une. Mme Frederic lui demande expressément de ne parler de cela à personne et lui donne une adresse à laquelle il doit se rendre le lendemain.
Le lendemain, Pete se rend dans le Dakota du Sud, et guidé par son GPS, il cherche l'endroit indiqué par Mme Frederic. Il se trompe d'abord, et finit par trouver l'endroit perdu dans un terrain vague.
Ses yeux se posent sur un vieu batiment, un entrepôt. Personne n'est là pour l'accueillir à son arrivée. Alors qu'il dit son nom d'une voix forte tout en s'approchant de l'entrepot, il est manqué de peu par un ballon venant d'il ne sait où. Une voiture s'approche et l'agent Myka Bering en sort, ne comprenant pas ce que Pete fait ici. Ils constatent tout deux qu'ils ont eu le soir, la visite de la même femme.
La porte d'entrée de l'entrepôt s'ouvre seule. Et derrière eux, à l'opposé de la porte, se tient l'homme que Pete a vu au musée, celui qui a emporté la tête aztèque, Pete sort son arme. Il leur dit son identité : Arthur Nielsen, de surnom Artie, déclarant que l'entrepôt appartient au gouvernement, et qu'en fait, lui aussi. Pete range son pistolet, tandis que Artie les invite à entrer dans l'entrepôt. Les deux agents sont un peu rétissants, mais Pete l'est moins quand Artie leur dit qu'il a fait des cookies. Tous les trois longent un couloir blanc avant de pouvoir entrer dans le bureau de l'entrepôt, décoré de toutes sortes de choses anciennes.
Puis Artie leur fait découvrir la grandeur du batiment qu'il appelle "le grenier de l'Amérique". A nouveau dans le bureau, il leur explique la raison de leur venue : il devront l'aider à collecter et protéger des secrets; et la raison pour laquelle ils ont étés choisit tous les deux est le fait qu'ils sont complémentaires : "Pete a l'intuition, elle est observatrice, il est touche à tout et Myka elle est méticuleuse, elle regarde, il survole." Mika préfère sortir pour téléphoner à Dickinson. Ce dernier n'est visiblement pas au courant de ce transfert et lui dit qu'il va tout faire pour la récupérer, mais en attendant, elle doit faire ce qu'ils lui demandent. Pendant ce temps, Pete est avec Artie qui connait son passé avec ses problèmes d'alcool.
Artie leur fait ensuite visiter l'entrepot à bord d'un véhicule étrange. Les deux personnes à l'avant doivent tenir une barre pour que la machine avance, fonctionnant grâce à l'énerie de leur corps. C'est une invention de Thomas Edison. Il s'arrêttent et immédiatement, une boule d'électricité leur arrive droit dessus, Artie leur dit que c'est de l'électricité statique évacuée par le stock. Alors qu'il leur explique les fonctions de l'entrepôt 13, il s'apperçoit que Pete tient quelque chose dans sa main, une bouilloire qui exhausse les souhaits. Artie demande alors à Pete de ne penser à rien, mais Myka attrape l'objet et fait un voeux en silence. Un furet apparait dans la bouilloire, ne pouvant pas donner résultat au souhait qu'elle avait formulé : ne pas rester dans l'entrepôt. Artie prend la bouilloire et la plonge dans une substance violette qu'il appelle, le gel neutralisant, qui aurait la capacité de neutraliser les artéfacts réveillés.
Pete ne comprenant pas la raison exacte de leur présence, Artie leur explique qu'ils doivent ramener les artéfacts à l'entrepôt après les avoir neutralisés, pour qu'ils y soient enfermés.
Artie les envoie dans une pension tenue par Leena. Elle les accueille et leur présente le fonctionnement de la pension et leur montre leur chambre. Myka emporte son furet. Leena parait à première vue, bien cerner les gens. Myka tourne en rond dans sa chambre et sans faire attention, elle fait tomber un objet de son sac, un objet qui s'y était glissé quand elle était encore à l'entrepôt 13. Assise sur son lit, elle regarde une photo d'elle accompagnée d'un homme, et entend soudaint la voix de l'homme de la photo, qui apparait derrière elle quelques secondes sans qu'elle ne le voit.
Mme Frederic contacte Artie pour savoir comment ça se passe avec les nouvelles recrues. Sur le coup, Artie doute qu'ils soient les bonne personnes pour assurer ce travail, mais Mme Frederic lui affirme qu'elle connait leurs faiblesses. Elle lui demande de trouver un moyen de les retenir, car Dickinson veut les récupérer. Le soir, Pete et Myka discutent.
Le lendemain matin, Artie leur confie leur première mission. Trouver l'artéfact qui a modifié le comportement d'un jeune homme habituellement sans histoire, le rendant violent envers sa petite amie. Il leur donne alors une liste de questions à poser au jeune homme, un récipient contenant du gel neutraliseur, un visiophone (une sorte de téléphone portable doté de la vidéo) inventé par Filo Farnsworth, ainsi qu'un tesla, pistolet neutralisant qu'avait utilisé Artie sur l'agent du musée, et qui efface la mémoire à court terme. Pete et Myka doivent trouver l'artéfact, le neutraliser et le raporter à l'entrepot 13.